「 行业资讯 」你是否曾触碰ICLAC黑名单中的“问题细胞”？

你能确定自己精心培养的细胞,真的如其所“宣称”的那样吗？

每年，无数满怀热忱的科研人员踏入实验室，却可能带着遗憾离开；因为辛辛苦苦培养的细胞，某天突然发现并非自己所认为的那个“它”。结果可能会实验结果遭受质疑、论文面临撤稿风险，前期投入的大量时间和精力付诸东流，一切可能都要重新开始……

如何避免“细胞选错，实验白做”？

科研道路上，细胞污染和身份错误的问题时有发生。我们也遇到过一些真实案例，进一步说明细胞鉴定的重要性。

真实案例：Huh-7？不！竟然是CHO细胞！

背景：

某实验团队使用Huh-7细胞（人肝癌细胞）进行Bulk RNA-seq分析，原计划研究其在肝病中的转录组变化。

问题发现：

数据比对后，发现RNA-seq数据的比对率异常，基因表达谱也与预期不符。进一步分析发现，该项目物种为“人”，经比对后发现6个样本的比对率都非常低。因此进行NR数据库评估，结果发现Top1的物种为“中国仓鼠（Cricetulus griseus）”。

具体NR评估结果：

后果：

1. 该团队已经基于该细胞发表了多篇论文，但实验结果的可靠性受到严重质疑。

2. 若被同行发现或举报，论文可能会被撤稿，影响研究信誉。

3. 之前基于该细胞进行的所有研究可能全部失效，项目需要重新评估。

可能的污染来源：

1.细胞供应商或实验室早期培养过程中，细胞被误标，导致长期使用错误细胞。

2.交叉污染：实验过程中，CHO细胞可能污染了Huh-7细胞系，并逐渐占据培养环境。

3.缺乏短串联重复序列（Short Tandem Repeats，STR）鉴定：如果实验室未定期进行STR鉴定，误用的细胞可能长期未被发现。

1.交叉污染：细胞界的“狸猫换太子”

一些细胞系具有极强的生存能力，能够悄然无声地侵占其他细胞的培养空间。例如，声名远扬的HeLa细胞，据统计，它已经污染了全球超过500种细胞系。倘若你实验室中的细胞出现异常旺盛的生长态势，那么很有可能，你的细胞已经被HeLa细胞“掌控”了。

2.细胞身份误认：科研版“你不是你”

国际细胞错误目录（International Cell Line Authentication Committee, ICLAC）统计过大量案例，很多研究人员一开始信誓旦旦地用着某种细胞系，结果短串联重复序列（Short Tandem Repeats, STR）鉴定一查，发现它压根不是自己以为的那种细胞，甚至属于完全不同的物种！这种错误会直接导致下游实验效果不佳，数据无法重复，严重影响科研成果的可靠性。

ICLAC名单里“问题细胞”自查

ICLAC整理了一份已知因交叉污染或其他机制而被错误识别的细胞系登记册，最新版本发布于2024年4月26日。目前被登记的细胞错误情况，具体来说：

数据规模：

• 目前ICLAC目录中列出了593种细胞系。
• 为确保数据的准确性，已排除了一些本身来源相同、但经人为有意衍生出的细胞系。

错误细胞的分类：

• 545 种细胞已被确认身份错误，且无法追溯到已知的真实来源（这些细胞列于Table 1）。
•  48种细胞曾被认为身份错误，但后来找到了真实的来源，因此被单独列出（Table 2）。

具体的污染类型：

• 78种细胞与原始供体不匹配，且污染来源不明。
•  70种细胞属于跨物种污染。
•  9种非人类细胞被检测到存在同种内污染。

主要污染源：

• 在157种不同的污染来源中，HeLa细胞是最常见的污染源（145次）。
• 其次是T-24细胞（21次）和M14细胞（18次）。

以下列出了部分被HeLa、T-24、M14等污染的细胞系，以及跨物种污染鉴定：

（完整文件下载链接：https://iclac.org/databases/cross-contaminations/）

值此国自然申请关键时刻，

科研人员们不妨赶紧自查一下，

看看自己实验室中是否存在“上榜”的细胞

若您目前正在培养的细胞属于545个被错误鉴定的细胞之一，请尽快暂停相关项目。若细胞属于表2中的48个细胞系，建议先进行细胞STR鉴定，以排查是否存在污染情况。

科研路漫漫，避坑指南要牢记：

• 做STR鉴定：每次获取新细胞时，不要急于培养，应首先进行 STR 检测，以避免使用到错误细胞。
• 选择正规细胞库：诸如 ATCC、DSMZ 等权威细胞库，是获取可靠细胞的最佳来源。
• 规范实验室管理：在实验室操作过程中，要规范培养皿的摆放和使用，防止不同细胞系之间发生交叉污染。
• 关注ICLAC数据库：定期查阅ICLAC数据库更新的细胞错误名单，及时确认自己使用的细胞是否“榜上有名”。

科研工作需要严谨细致，小心谨慎方能稳步前行！